Estniska Rederiföreningen kräver tillsammans med estniska arbetsgivareföreningen, fackföreningarnas centralorganisation samt sjömansfacket en förändrad statlig sjöfartspolitik. Rederiföreningen tycker att det är en brist att sjöfarten inte behandlas som ett eget näringsområde, vilket påverkar andelen estniskflaggade fartyg. I Estland finns ett tiotal tjänstemän för sjöfartsnäringen på närings- och kommunikationsministeriet, medan det för jordbruk finns 800 tjänstemän på statlig nivå.