Föreningen Svensk Sjöfart hade fram tills nyligen den sammankallande rollen för Vågrätt-samarbetets två operativa konstellationer, Styrgruppen och Arbetsgruppen, som har regelbundna möten. Nu tar Seko sjöfolk över rollen som sammankallande i två år och därefter ska uppdraget växla mellan parterna som ingår i samarbetet.